Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms