Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23aQ01405 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms