Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited1P97769 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms