Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms