Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

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Length 1,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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