Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msx3P70354 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Msx3P70354 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Msx3P70354 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Msx3P70354 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msx3P70354 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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