Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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