Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SbdsP70122 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SbdsP70122 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SbdsP70122 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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