Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hmgb1P63158 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms