Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap25P60879 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap25P60879 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap25P60879 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snap25P60879 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snap25P60879 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snap25P60879 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms