Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms