Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CartptP56388 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CartptP56388 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CartptP56388 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms