Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs12P50716 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs12P50716 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa-rs12P50716 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa-rs12P50716 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms