Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tmod1P49813 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmod1P49813 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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