Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtpreP49446 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtpreP49446 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtpreP49446 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtpreP49446 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtpreP49446 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms