Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms