Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GdnfP48540 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GdnfP48540 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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