Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sept1P42209 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sept1P42209 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sept1P42209 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms