Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms