Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap1P40124 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms