Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrgP28705 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RxrgP28705 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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