Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxraP28700 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxraP28700 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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