Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc6a9P28571 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms