Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd10P28359 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd10P28359 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms