Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa5P28312 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms