Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gjb1P28230 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gjb1P28230 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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