Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NefhP19246 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NefhP19246 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NefhP19246 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms