Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18530 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18530 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18530 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms