Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpraP18052 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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