Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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