Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms