Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms