Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm3P0DP28 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms