Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm2P0DP27 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm2P0DP27 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms