Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
UbbP0CG49 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms