Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ifna9P09235 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifna9P09235 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms