Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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