Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
TtrP07309 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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TtrP07309 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TtrP07309 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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