Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Me1P06801 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Me1P06801 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Me1P06801 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Me1P06801 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Me1P06801 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Me1P06801 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Me1P06801 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Me1P06801 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Me1P06801 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Me1P06801 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Me1P06801 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Me1P06801 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Me1P06801 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms