Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa4P06798 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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