Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06330 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06330 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06330 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06330 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06330 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06330 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06330 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06330 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06330 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06330 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06330 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms