Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms