Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcnkO88874 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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