Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Stra6O70491 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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