Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EdaO54693 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EdaO54693 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
EdaO54693 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EdaO54693 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EdaO54693 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
EdaO54693 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EdaO54693 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EdaO54693 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EdaO54693 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms