Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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