Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Slc18a3O35304 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms