Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptpn9O35239 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptpn9O35239 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptpn9O35239 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptpn9O35239 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ptpn9O35239 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ptpn9O35239 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ptpn9O35239 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ptpn9O35239 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptpn9O35239 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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