Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms