Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms